如何提高微生物发酵过程中目标产物生物表面活性剂的产量，是项目需要解决的首要问题。

    早在“十一五”期间，项目组就开始关注生物基驱油剂的动向，开展可行性论证和实地考察，就如何提高生物基驱油剂的发酵产率这一关键技术问题进行思考和讨论。

    经过深入而细致的分析，大家一致认为，“治病”得从“病根”入手：要想让微生物变得更“活泼”，发酵出更多的活性驱油剂，仅仅改变外部环境是不够的，必须从微生物的内部基因下手进行改造，才能实现发酵效率的质变。

    近年来，我国基因工程的飞速发展为这个创意的实践提供了契机。基于合成生物技术，研发人员构建了多重基因工程改造菌株，使菌株的发酵活性实现了质的飞跃，发酵产量提升了40倍，突破了该领域的核心技术瓶颈。

    在发酵产率得以提高后，研发人员开始集中精力揭开改造菌株的神秘面纱。

    项目组联合南京工业大学、清华大学对改造菌株进行了大量基因组测序工作，证明了该项目所得改造菌株的原创性。在项目组专家的努力推动下，改造菌株成功获得了国际菌种认证，并在国家菌种保藏库中建立了专属菌种保藏号，拥有完全的自主知识产权。

    随后，项目组基于国际首创的改造菌株开展了放大发酵生产试验。此时，微生物发酵产生的大量泡沫又成为了阻碍连续循环发酵的“拦路虎”。

    发酵过程中，大量泡沫从灌顶溢流，造成了底物利用不完全、杂菌污染等问题，严重制约了菌株的发酵效率。项目组从优化发酵罐设计和发酵参数入手，经过多次尝试，最终攻克了生物表面活性剂连续循环发酵工艺难题，创新解决了发酵泡沫对生产的制约问题，使发酵效率提升了60%以上，产品产率、底物转化率和发酵规模均处于行业领先水平。

    在此基础上，项目组又通过技术攻关实现了脂肽、鼠李糖脂、槐糖脂等3种主要活性产物的选择性强化发酵，可根据不同原油性质，调节发酵液中活性组分的比例，从而实现生物基驱油剂和原油性质的匹配。